不会怎样，民办学校有学籍，无论公办学校还是民办学校都必须为学生注册学籍。学籍是指一个学生属于某学校的一种法律上的身份或者资格，登记学生姓名的册子，专指作为某校学生的资格。2013年9月1日起，全国已经初步建立了小中大学籍的信息管理系统。